Per proprietà microscopiche della materia si intendono le caratteristiche della materia riconducibili alla struttura, alla composizione e alle interazioni delle particelle che la costituiscono. È importante saper distinguere elementi, composti, molecole e ioni, e utilizzare la tavola periodica per riconoscere regolarità e prevedere semplici proprietà degli elementi. Inoltre, è utile saper mettere in relazione struttura atomica, configurazione elettronica, tipo di legame e geometria molecolare con le proprietà osservabili delle sostanze.